Родился в 1969 году. В 1993 году окончил Московскую государственную консерваторию имени П.И. Чайковского по специальности «гобой» (класс профессора М.М. Оруджева). В 1995 году прошел ассистентуру-стажировку в Московской консерватории. Стажировался как гобоист в Международной Академии И.-С. Баха в Штуттгарте у И. Горитцки (1990, 1993 годы), как блокфлейтист – у Р. Клеменчичв (1992 год).

Лауреат I премии Всесоюзного конкурса исполнителей на духовых инструментах (1991 год).

С 1990 по 1998 год как гобоист, блокфлейтист работал в оркестре Московского Баховского центра. В 1993-2009 годах являлся солистом ансамбля «Мадригал». С 1995 по 2007 год – концертмейстер группы гобоев Симфонического оркестра России под руководством В. Дударовой. С 1998 года по настоящее время является концертмейстером группы гобоев Московского академического Музыкального театра имени К.С. Станиславского и Вл. И. Немировича-Данченко. С 2010 года – солист ансамбля старинной музыки Volkonsky Consort. С 2019 года является концертмейстером группы гобоев Симфонического оркестра радио «Орфей». Руководитель Камерного ансамбля Московского Баховского центра.

В разные годы в качестве блокфлейтиста сотрудничал с камерными коллективами Москвы. 

С 1993 по 2000 год – преподаватель по классу блокфлейты и гобоя в Детской музыкальной школе имени Гнесиных при Московской средней специальной музыкальной школе (колледже) имени Гнесиных. С 2014 года Алексей Шеин преподает музыкальные дисциплины в школе «Незнайка» для детей с особенностями развития при фонде «Дети.мск.ру». С 2021 года является преподавателем в Московской консерватории по классам ансамбля духовых инструментов и консорта блокфлейт (факультет исторического и современного исполнительского искусства).

май 2025