Евгений Волков родился в Москве в 1975 году. В 1995 окончил теоретическое отделение Академического музыкального колледжа при МГК, в 2000 – с отличием дирижёрско-хоровой факультет Московской государственной консерватории, в 2002 – аспирантуру при ней (класс хорового дирижирования Народного артиста России, профессора Бориса Григорьевича Тевлина; по оперно-симфоническому дирижированию занимался в классе профессора Игоря Артуровича Дронова). Участвовал в мастер-классах профессоров Эрика Эриксона (Москва, 2001), Герта Фришмута и Габора Холлерунга (Вернигероде (Германия), 2003).
Преподаёт в Московской консерватории с 2000 года. Хормейстерскую деятельность ведет с 1995 года.
По приглашению Учителя занял пост хормейстера Государственного академического русского хора им. А.В. Свешникова в 2008 году; с 2011 – главный хормейстер коллектива.
С августа 2012 года является Художественным руководителем Госхора имени А.В. Свешникова. Под управлением дирижёра коллектив подготовил ряд ярких разноплановых программ, в том числе ряд российских и мировых премьер композиторов-классиков и современников.
Наряду с исполнительской и педагогической деятельностью музыкант ведёт активную исследовательскую работу в сфере хорового искусства и музыкознания. Член Президиума Всероссийского хорового общества (с 2013 г.)
Автор научных статей, очерков, творческих портретов, сценариев, рецензий, эссе, произведений художественной литературы.